клеток
единичных
биологии
лаборатория
заведующий лабораторией
Денисов Евгений Владимирович
Доктор биологических наук
Денисов
Евгений
Владимирович
Образование высшее, в 2007 году с отличием окончил магистратуру Биологического института Томского государственного университета
С 2007 по 2010 год обучался в очной аспирантуре Биологического института Томского государственного университета, выполняя научно-исследовательскую работу на базе НИИ онкологии СО РАМН
Докторская: Внутриопухолевая морфологическая гетерогенность рака молочной железы. Клинические и молекулярно-генетические особенности, 2022 год
h-индекс 29
i10-индекс 61
Хобби: рыбалка, грибы, лыжи, велосипед, путешествия
«Каждая клетка имеет значение»
Направления
деятельности
02
Молекулярный атлас сарком мягких тканей
01
Молекулярный атлас злокачественных лимфопролиферативных заболеваний детского возраста
Компетенции
Полногеномное, полноэкзомное, полнотранскриптомное, бисульфитное и таргетное секвенирование
Секвенирование ДНК единичных клеток
Секвенирование РНК единичных клеток
Пространственная транскриптомика
Биоинформатический анализ
проекты
  • Современные молекулярно-генетические технологии для разработки новых алгоритмов персонализации терапии сарком мягких тканей
    РНФ 23-65-00003
коллаборации
Институт системного программирования им. В.П. Иванникова РАН
НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева
НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина
Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Публикации
  • Soft tissue sarcomas at the single-cell and spatial resolution: new markers and targets
    Menyailo M.E., Kopantseva E.E., Khozyainova A.A., Korobeynikova A.A., Denisov E.V. Soft tissue sarcomas at the single-cell and spatial resolution: new markers and targets. Cancer Gene Therapy 2024. DOI: 10.1038/s41417-024-00856-7
  • GLOW Consortium. International Prognostic Score for Nodular Lymphocyte-Predominant Hodgkin Lymphoma
    Binkley M.S., Flerlage J.E., Savage K.J., Akhtar S., Steiner R., Zhang X.Y., Dickinson M., Prica A., Major A., Hendrickson P.G., Hopkins D., Ng A., Casulo C., Baron J., Roberts K.B., Al Kendi J., Balogh A., Ricardi U., Torka P., Specht L., … GLOW Consortium. International Prognostic Score for Nodular Lymphocyte-Predominant Hodgkin Lymphoma. Journal of Clinical Oncology 2024;42(19):2271-2280. DOI: 10.1200/JCO.23.01655
  • Decoding Chemotherapy Resistance of Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma at the Single Cell Resolution: A Case Report
    Fetisov T.I., Menyailo M.E., Ikonnikov A.V., Khozyainova A.A., Tararykova A.A., Kopantseva E.E., Korobeynikova A.A., Senchenko M.A., Bokova U.A., Kirsanov K.I., Yakubovskaya M.G., Denisov E.V. Decoding Chemotherapy Resistance of Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma at the Single Cell Resolution: A Case Report. Journal of Clinical Medicine 2024;13:7176. DOI: 10.3390/jcm13237176
  • TP53 variants underlying pediatric low-hypodiploidy B-cell acute lymphoblastic leukemia demonstrate diverse origins and may persist as a hematopoietic clone in remission
    Itov A., Ilyasova K., Soldatkina O., Kazakova A., Kozeev V., Semchenkova A., Osipova E., Boichenko E., Volchkov E., Popov A., Zerkalenkova E., Roumiantseva J., Novichkova G., Karachunskiy A., Olshanskaya Y. TP53 variants underlying pediatric low-hypodiploidy B-cell acute lymphoblastic leukemia demonstrate diverse origins and may persist as a hematopoietic clone in remission. EJHaem 2024;5(5):1010-1013. DOI: 10.1002/jha2.986
  • Patysheva M.R., Kolegova E.S., Khozyainova A.A., Prostakishina E.A., Korobeynikov V.Y., Menyailo M.E., Iamshchikov P.S., Loos D.M., Kovalev O.I., Zavyalova M.V., Fedorova I.K., Kulbakin D.E., Larionova I.V., Polyakov A.P., Yakovleva L.P., Kropotov M.A., Sukortseva N.S., Lu Y., Jia L., Arora R., Choinzonov E.L., Bose P., Denisov E.V. Revealing molecular mechanisms of early-onset tongue cancer by spatial transcriptomics. Scientific Reports 2024;14:26255. DOI: 10.1038/s41598-024-76044-2
  • Characterization of a Novel Pathogenic PLCG2 Variant Leading to APLAID Syndrome Responsive to a TNF Inhibitor
    Yang Z., Tao P., Han X., Kozlova A., He T., Volchkov E., Nesterenko Z., Pershin D., Raykina E., Fatkhudinov T., Korobeynikova A., Aksentijevich I., Yang J., Shcherbina A., Zhou Q., Yu X. Characterization of a Novel Pathogenic PLCG2 Variant Leading to APLAID Syndrome Responsive to a TNF Inhibitor. Arthritis & Rheumatology 2024;76(11):1670-1678. DOI: 10.1002/art.42948
  • Whole-exome sequencing reveals an association of rs112065068 in TGOLN2 gene with distant metastasis of non-small cell lung cancer
    Gerashchenko T., Skitchenko R., Korobeynikova A., Kuanysheva K., Khozyainova A., Vorobiev R., Rodionov E., Miller S., Topolnitsky E., Shefer N., Anisimenko M., Zhuikova L., Vashisth M., Pankova O., Perelmuter V., Rezapova V., Artomov M., Denisov E. Whole-exome sequencing reveals an association of rs112065068 in TGOLN2 gene with distant metastasis of non-small cell lung cancer. Gene 2024;920:148507. DOI: 10.1016/j.gene.2024.148507
  • Potential value of high-throughput single-cell DNA sequencing of Juvenile myelomonocytic leukemia: report of two cases
    Volchkov E.V., Khozyainova A.A., Gurzhikhanova M.K., Larionova I.V., Matveev V.E., Evseev D.A., Ignatova A.K., Menyailo M.E., Venyov D.A., Vorobev R.S., Semchenkova A.A., Olshanskaya Yu.V., Denisov E.V., Maschan M.A. Potential value of high-throughput single-cell DNA sequencing of Juvenile myelomonocytic leukemia: report of two cases. npj Systems Biology and Applications 2023;9:41. DOI: 10.1038/s41540-023-00303-7
  • Comparison of the Illumina NextSeq 2000 and GeneMind Genolab M sequencing platforms for spatial transcriptomics
    Iamshchikov P., Larionova I., Gerashchenko T., Piankov D., Koshkin P., Korostelev S., Denisov E. Comparison of the Illumina NextSeq 2000 and GeneMind Genolab M sequencing platforms for spatial transcriptomics. BMC Genomics 2023;24:102. DOI: 10.1186/s12864-023-09192-w
  • How to catch metastatic seeds. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)
    Gerashchenko T.S., Schegoleva A.A., Khozyainova A.A., Choinzonov E.L., Denisov E.V. Metastasis prevention: How to catch metastatic seeds. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Reviews on Cancer 2023;1878(3):188867. DOI: 10.1016/j.bbcan.2023.188867