Биологии
Лаборатория
Структурной
Молодцов
Вадим
Николаевич
Вадим
Николаевич
Ph.D. по специальности клеточная и молекулярная биология Образование высшее, в 2003 году окончил биологический факультет
Российского Государственного Педагогического Университета им.
А.И. Герцена.
Российского Государственного Педагогического Университета им.
А.И. Герцена.
С 2005 по 2010 год обучался в очной аспирантуре в University of Medicine
and Dentistry of New Jersey (в настоящее время - Rutgers University, NJ, Ph.D. диссертация: Transcript slippage as a pathway to termination in T7 RNA polymerase, 2010 год)
and Dentistry of New Jersey (в настоящее время - Rutgers University, NJ, Ph.D. диссертация: Transcript slippage as a pathway to termination in T7 RNA polymerase, 2010 год)
п-индекс 14, 110-индекс 17
Хобби: туризм, авиация, парашютизм, чтение
Направления
деятельности
02
Исследование молекулярных механизмов транскрипции при старении
04
Направленный дизайн антибиотиков
03
Исследование молекулярных механизмов антивирусного иммунитета у бактерий
05
Разработка биомедицинских технологий на основе рекомбинантных белков
01
Исследование структурных основ транскрипции и трансляции в прокариотах
Компетенции
Создание экспрессионных векторов для получения рекомбинантных белков в бактериях
Хроматографическая очистка рекомбинантных белков
Анализ активности рекомбинантных белков методами биохимии in vitro
Структурный анализ белков и их комплексов методами рентгеноструктурного анализа
Структурный анализ белков и их комплексов методами криоэлектронной микроскопии
Направленный дизайн антибиотиков на основе структурного анализа белка-мишени
Разработка и оптимизация белков с заданными свойствами для биомедицинских технологий
проекты
Исследование структурной организации транскрипционного аппарата микоплазмы и разработка специфичного антибиотика-ингибитора транскрипции в микоплазме.
Инициативная тема
Исследование молекулярных механизмов транскрипции при физиологическом старении
Инициативная тема
Создание улучшенных факторов роста человека для развития технологий регенерации тканей
Инициативная тема
Исследование структурной организации систем антивирусной защиты у бактерий
Грант РНФ 24-74-10089
Shanghai Institute of Immunity and Infections, CAS
коллаборации
МГНЦ им.Н.П.Бочкова РАН
Сколковский институт науки и технологий
Публикации
Structural basis of archaeal FttA-dependent transcription termination
You L, Wang C, Molodtsov V, Kuznedelov K, Xinyi M, Wenck B, Ulisse P, Sanders TJ, Marshall CJ, Firlar E, Kaelber JT, Santangelo TJ, Ebright RH. Structural basis of archaeal FttA-dependent transcription termination. (2024) Nature doi: 10.1038/s41586-024-07979-9.
Structural basis of transcription-translation coupling by RfaH
Molodtsov V, Wang C, Zhang J, Kaelber JT, Blaha G, Ebright RH. Structural basis of transcription-translation coupling by RfaH. (2024) Nature Structural and Molecular Biology 10.1038/s41594-024-01372-w.
Structural basis of Rho-dependent transcription termination
Molodtsov V, Wang C, Firlar E, Kaelber JT, Ebright RH. Structural basis of Rho-dependent transcription termination. (2023) Nature 614(7947):367-374.
Redesign of Rifamycin Antibiotics to Overcome ADP-Ribosylation-Mediated Resistance
Lan T, Ganapathy US, Sharma S, Ahn Y-M, Zimmerman M, Molodtsov V, Ebright RH, Dartois V, Freundlich JS, Dick T, Aldrich CC. Redesign of Rifamycin Antibiotics to Overcome ADP-Ribosylation-Mediated Resistance. (2022) Angewandte Chemie. 61(45):e202211498.
Structural and mechanistic basis of σ-dependent transcriptional pausing
Pukhrambam C, Molodtsov V, Kooshbaghi M, Tareen A, Vu H, Skalenko KS, Su M, Zhou Y, Winkelman JT, Kinney JB, Ebright RH, Nickels BE. Structural and mechanistic basis of σ-dependent transcriptional pausing. (2022) PNAS 119(23):e2201301119.
Design, synthesis, and characterization of TNP-2198, a dual-targeted rifamycin-nitroimidazole conjugate with potent activity against microaerophilic and anaerobic bacterial pathogens
Ma Z, He S, Yuan Y, Zhuang Z, Liu Y, Wang H, Chen J, Xu X, Ding C, Molodtsov V, Lin W, Robertson GT, Weiss WJ, Pulse M, Nguyen P, Duncan L, Doyle T, Ebright RH, Lynch AS. Design, synthesis, and characterization of TNP-2198, a dual-targeted rifamycin-nitroimidazole conjugate with potent activity against microaerophilic and anaerobic bacterial pathogens. (2022) Journal of Medicinal Chemistry 65(6):4481-4495.
Structural basis of RNA polymerase recycling by the Swi2/Snf2 ATPase RapA in Escherichia coli
Qayyum MZ, Molodtsov V, Renda A, Murakami KS. Structural basis of RNA polymerase recycling by the Swi2/Snf2 ATPase RapA in Escherichia coli. (2021) Journal of Biological Chemistry 297(6):101404.
Structural basis of transcription-translation coupling
Wang C, Molodtsov V, Firlar E, Kaelber JT, Blaha G, Su M, Ebright RH. Structural basis of transcription-translation coupling. (2020) Science 369(6509):1359-1365.
Evaluation of bacterial RNA polymerase inhibitors in a Staphylococcus aureus–based wound–infection model in SKH1 mice
Haupenthal J, Kautz Y, Elgaher W, Patzold L, Roehrig T, Laschke M, Tschernig T, Hirsch A, Molodtsov V, Murakami K, Hartmann R, Bischoff M. Evaluation of bacterial RNA polymerase inhibitors in a Staphylococcus aureus–based wound–infection model in SKH1 mice. (2020) ACS Infectious Diseases. 6(10):2573-2581.
RNA extension drives a stepwise displacement of an initiation-factor structural module in initial transcription
Li L, Molodtsov V, Lin W, Ebright RH, Zhang Y. RNA extension drives a stepwise displacement of an initiation-factor structural module in initial transcription. (2020) PNAS. 117(11):5801-5809.